पाचन तंत्र में पोषक तत्वों का अपर्याप्त अवशोषण, जिसे कुअवशोषण (malabsorption) के रूप में जाना जाता है, विभिन्न स्वास्थ्य समस्याओं को जन्म देता है। अल्पकालिक रूप से, अवशोषित न होने वाले पोषक तत्व गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल असुविधाएँ पैदा करते हैं, मुख्य रूप से दस्त, गैस और पेट फूलना। कुअवशोषण सिंड्रोम में अक्सर देखी जाने वाली दस्त की समस्या, पोषक तत्वों को शरीर से तेजी से बाहर निकालकर स्थिति को और खराब कर देती है, जिससे अवशोषण का समय और कम हो जाता है। दीर्घकालिक रूप से, निरंतर पोषक तत्व की कमी गंभीर जटिलताओं को जन्म देती है। मैक्रोन्यूट्रिएंट्स (प्रोटीन, वसा या कार्बोहाइड्रेट) का अपर्याप्त अवशोषण मांसपेशियों की हानि और कमजोर प्रतिरक्षा प्रणाली का कारण बन सकता है। माइक्रोन्यूट्रिएंट्स (विटामिन और खनिज) की कमी आंखों, हड्डियों, त्वचा और बालों के स्वास्थ्य को नकारात्मक रूप से प्रभावित करती है।