La cause exacte du trouble du spectre de l'autisme (TSA) n'est pas entièrement comprise et ne peut être réduite à un seul facteur fondamental. Les recherches indiquent que le TSA est une condition multifactorielle résultant d'une interaction complexe de facteurs génétiques et non génétiques. Ces facteurs incluent des influences environnementales telles que les complications à la naissance, les infections virales et la pollution environnementale. Il est estimé que plus de 100 gènes sur différents chromosomes peuvent contribuer au TSA avec des degrés de sévérité variés. De plus, bien que rarement, des caractéristiques autistiques sont observées dans certaines maladies génétiques, des conditions neurométaboliques (troubles de la chimie cérébrale) ou des situations telles que l'épilepsie, qui altèrent les fonctions cérébrales et la communication cellulaire.