Endometriozis (çikolata kisti) ile ilişkili ağrı genellikle adet sancısı şeklinde ortaya çıkar. Bu ağrılar tipik olarak adetten hemen önce başlar ve adet dönemi boyunca devam eder. Hastalar, özellikle kasık bölgesinde yoğunlaşan, bacaklara ve bele yayılan ağrılardan yakınabilirler. Endometriozis ayrıca cinsel ilişki sırasında ağrıya (disparoni) neden olabilir. Bazı durumlarda, bağırsaklarda veya idrar torbasında da ağrıya rastlanabilir.