Как и любая хирургическая процедура, операции по поводу невралгии тройничного нерва сопряжены с определенными рисками. Комплексная оценка состояния пациента крайне важна для успешного хирургического вмешательства. Сопутствующие заболевания, такие как гипертония, диабет или хронические заболевания легких, могут увеличить риск послеоперационных осложнений; поэтому эффективное управление или лечение этих состояний до операции имеет решающее значение. Помимо рисков, связанных с анестезией, и общих системных рисков, каждая хирургическая процедура также имеет свои специфические риски. Все эти риски могут быть значительно снижены благодаря опыту хирурга, его тщательности и передовым хирургическим методикам.

Специфические риски, которые могут возникнуть при операциях микрососудистой декомпрессии (МВД):
* Проблемы с раной (инфекция, проблемы заживления)
* Утечка спинномозговой жидкости (СМЖ)
* Временный паралич или слабость лица
Хотя большинство этих рисков может быть предотвращено благодаря внимательной и усердной работе хирурга, они никогда не могут быть полностью исключены.

При перкутанных абляционных процедурах, выполняемых через овальное отверстие, могут наблюдаться следующие риски:
* Сохранение боли (неэффективность лечения)
* Постоянное онемение лица
* Сухость глаз
* В очень редких случаях развитие постоянной боли в лице
Когда в качестве метода абляции выбирается баллонная компрессия, вероятность развития постоянной боли в лице значительно ниже. Однако при применении радиочастотной абляции и алкоголя этот риск может быть выше.