Na terapia de ablação, o tecido cardíaco que causa a arritmia é o alvo. Neste procedimento, um tubo fino e flexível, conhecido como cateter, é tipicamente inserido nos vasos sanguíneos e guiado em direção ao coração. Uma vez alcançada a área alvo no coração, várias fontes de energia, como calor (ablação por radiofrequência), frio (crioablação), laser ou substâncias químicas, são aplicadas para inativar o tecido. Através desses métodos, as vias elétricas responsáveis pela produção de ritmos cardíacos irregulares ou anormais são eliminadas.

Especificamente na ablação por radiofrequência (calor), ondas de rádio são usadas para aquecer precisamente o tecido alvo. Esta área, exposta a temperaturas tipicamente entre 50 e 70 graus Celsius, perde completamente sua função. Assim, a parte que causa a arritmia e as palpitações é desativada permanentemente, e o ritmo cardíaco do paciente retorna ao normal.