एब्लेशन थेरेपी में, अतालता (arrhythmia) पैदा करने वाले हृदय ऊतक को लक्षित किया जाता है। इस प्रक्रिया में, कैथेटर नामक एक पतली, लचीली ट्यूब को आमतौर पर रक्त वाहिकाओं के माध्यम से हृदय की ओर निर्देशित किया जाता है। एक बार जब हृदय में लक्ष्य क्षेत्र तक पहुंच जाता है, तो ऊतक को निष्क्रिय करने के लिए गर्मी (रेडियोफ्रीक्वेंसी एब्लेशन), ठंड (क्रायोएब्लेशन), लेजर या रसायनों जैसे विभिन्न ऊर्जा स्रोतों का उपयोग किया जाता है। इन तरीकों से, हृदय द्वारा अनियमित या असामान्य लय उत्पन्न करने वाले विद्युत मार्ग समाप्त हो जाते हैं।

विशेष रूप से रेडियोफ्रीक्वेंसी (गर्मी) एब्लेशन में, रेडियो तरंगों का उपयोग करके लक्षित ऊतक को सटीक रूप से गर्म किया जाता है। यह क्षेत्र, आमतौर पर 50 से 70 डिग्री सेल्सियस के बीच के तापमान के संपर्क में आने पर, अपनी कार्यक्षमता पूरी तरह से खो देता है। इस प्रकार, अतालता और धड़कन का कारण बनने वाला हिस्सा स्थायी रूप से निष्क्रिय हो जाता है, और रोगी की हृदय गति सामान्य हो जाती है।