Ablasyon tedavisinde, aritmiye neden olan kalp dokusu hedeflenir. Bu prosedürde, genellikle kan damarları yoluyla kalbe doğru ilerletilen, kateter adı verilen ince ve esnek bir tüp kullanılır. Kalpteki hedef bölgeye ulaşıldığında, dokuyu etkisiz hale getirmek için ısı (radyofrekans ablasyon), soğuk (kriyoablasyon), lazer veya kimyasal gibi çeşitli enerji kaynakları uygulanır. Bu yöntemlerle, kalbin düzensiz veya anormal ritimler üretmesini sağlayan elektriksel yollar ortadan kaldırılır.

Özellikle radyofrekans (sıcak) ablasyonda, radyo dalgaları kullanılarak hedeflenen doku kontrollü bir şekilde ısıtılır. Genellikle 50 ila 70 santigrat derece arasındaki bir sıcaklığa maruz bırakılan bu bölge, işlevini tamamen kaybeder. Böylece, aritmiye ve çarpıntıya yol açan kısım kalıcı olarak devre dışı bırakılır ve hastanın kalp ritmi normale döner.