क्लाइनफेल्टर सिंड्रोम वाले बच्चे के माता-पिता के लिए सबसे महत्वपूर्ण प्रश्नों में से एक यह है कि क्या उनके बाद के बच्चों में इस स्थिति के दोहराने का जोखिम है। गैर-मोज़ेक क्लाइनफेल्टर सिंड्रोम आमतौर पर एक "डी नोवो" गुणसूत्र असामान्यता है, जिसका अर्थ है कि यह माता-पिता से विरासत में नहीं मिलता है। इसलिए, पिछले बच्चे में गैर-मोज़ेक क्लाइनफेल्टर सिंड्रोम की उपस्थिति बाद की गर्भधारण में सामान्य जनसंख्या जोखिम से परे पुनरावृत्ति के जोखिम को नहीं बढ़ाती है, क्योंकि माता-पिता में वाहक स्थिति की उम्मीद नहीं होती है। हालांकि, उन्नत माता-पिता की उम्र जैसे अन्य जोखिम कारकों का मूल्यांकन प्रत्येक व्यक्तिगत मामले में किया जाना चाहिए।
यदि क्लाइनफेल्टर सिंड्रोम वाला कोई व्यक्ति बच्चे पैदा करना चाहता है, तो उनकी संतानों में एन्युप्लोइडी, जैसे लिंग गुणसूत्र एन्युप्लोइडी (उदाहरण के लिए, XYY सिंड्रोम, XXX सिंड्रोम) और ट्राइसोमी 21 (डाउन सिंड्रोम) का जोखिम बढ़ सकता है। फिर भी, वैज्ञानिक अध्ययनों से पता चला है कि गैर-मोज़ेक क्लाइनफेल्टर सिंड्रोम वाले पुरुषों में, जहां फोकल शुक्राणु उत्पादन मौजूद होता है, सामान्य गुणसूत्र संरचना वाले परिपक्व युग्मक (gametes) का उत्पादन किया जा सकता है। यह खोज इस अवलोकन का समर्थन करती है कि इन व्यक्तियों से पैदा हुए बच्चों का विशाल बहुमत गुणसूत्र रूप से सामान्य होता है।