Rektum kanserinin erken teşhisi için düzenli tarama programları büyük önem taşır. Herhangi bir risk faktörü olmayan bireylerde, 50 yaşında rutin taramalara başlanması erken tanı açısından kritik öneme sahiptir. Risk faktörleri bulunan kişilerde ise tarama yaşı daha erkene çekilebilir. Sıklıkla, rektum kanseri tanısı, makattan kanama veya açıklanamayan demir eksikliği anemisi gibi belirtilerle yapılan kontroller sırasında konulmaktadır.

Tarama programları ve kesin tanı için en yaygın kullanılan yöntem kolonoskopidir. Kolonoskopi işlemi sırasında, şüpheli bölgelerden küçük doku örnekleri (biyopsi) alınır. Bu biyopsi örneklerinin laboratuvarda patolojik incelenmesi, rektum kanseri tanısının doğrulanmasında temel adımdır.