Keratokonusun kesin nedeni bilinmemekle birlikte, bilimsel çalışmalar genetik yatkınlığın bir rol oynadığını göstermektedir. Alerjik konjonktivit ve buna bağlı kronik göz ovuşturma da önemli risk faktörleri arasında sayılır. Ayrıca, Down Sendromu, Marfan Sendromu ve Osteogenezis İmperfekta gibi bazı sistemik ve genetik rahatsızlıklara sahip kişilerin hastalığı geliştirme riski artmıştır.