Несколько состояний могут быть перепутаны с боковым амиотрофическим склерозом (БАС); наиболее заметными из них являются рассеянный склероз (РС) и болезнь Паркинсона.

Рассеянный склероз является одним из наиболее распространенных состояний, которые могут имитировать БАС. На ранних стадиях как БАС, так и РС могут проявляться схожими симптомами, такими как мышечная ригидность, спазмы и затруднения при ходьбе. Однако по мере прогрессирования этих заболеваний их отличительные характеристики становятся более очевидными. РС — это аутоиммунное заболевание, поражающее миелиновую оболочку нервных клеток в головном и спинном мозге, тогда как БАС — это дегенеративное заболевание, которое в первую очередь поражает верхние и нижние мотонейроны, часто начинаясь в локализованной части тела.

Болезнь Паркинсона также имеет некоторые ранние сходства с БАС. Симптомы, такие как постуральная нестабильность на начальных стадиях, могут привести к диагностической путанице. Тем не менее, болезнь Паркинсона в первую очередь поражает определенные области мозга, а не оказывает широкое воздействие на нейроны по всему телу.