कोलन कैंसर को रोग के फैलने की सीमा के अनुसार वर्गीकृत किया जाता है। इसके पाँच मुख्य चरण (चरण 0, I, II, III, IV) हैं, और इनमें से कुछ चरणों को उप-चरणों में विभाजित किया गया है। कोलन कैंसर के चरण इस प्रकार हैं:

चरण 0: कार्सिनोमा इन सीटू
इस चरण में, असामान्य या कैंसर-पूर्व कोशिकाएं केवल कोलन की दीवार की सबसे भीतरी परत (म्यूकोसा) में पाई जाती हैं और गहरे ऊतकों में नहीं फैली हैं।

चरण I:
कैंसर कोलन की दीवार की भीतरी परतों (सबम्यूकोसा या मस्कुलरिस प्रोप्रिया) में फैल गया है, लेकिन लिम्फ नोड्स या दूर के अंगों में नहीं फैला है।

चरण II:
कैंसर कोलन की दीवार के साथ गहरे ऊतकों में फैल गया है, लेकिन पास के लिम्फ नोड्स या दूर के क्षेत्रों में नहीं फैला है। यह चरण इस बात पर आधारित उप-चरणों में विभाजित है कि ट्यूमर आंत की दीवार में कितनी गहराई तक घुस गया है:
चरण IIA: कैंसर कोलन की दीवार की बाहरी परतों (सबसेरोसा) तक पहुँच गया है, लेकिन दीवार को पूरी तरह से पार नहीं किया है।
चरण IIB: कैंसर ने कोलन की दीवार को पूरी तरह से पार कर लिया है और आसपास के ऊतक में फैल गया है, लेकिन पास के अंगों में कोई आक्रमण नहीं है।
चरण IIC: कैंसर ने कोलन की दीवार को भेदकर सीधे पास के अंगों (जैसे, मूत्राशय, गर्भाशय) में फैल गया है।

चरण III:
कोलन कैंसर पास के लिम्फ नोड्स में फैल गया है, लेकिन दूर के अंगों में मेटास्टेसाइज नहीं हुआ है। यह चरण आंत की दीवार में ट्यूमर के आक्रमण की डिग्री और प्रभावित लिम्फ नोड्स की संख्या के आधार पर उप-चरणों में विभाजित है:
चरण IIIA: ट्यूमर कोलन की दीवार की सतही या मध्य परतों में फैल गया है और 1 से 4 क्षेत्रीय लिम्फ नोड्स को प्रभावित किया है।
चरण IIIB: ट्यूमर कोलन की दीवार की बाहरी परतों या आसपास के ऊतकों में फैल गया है और 1 से 4 क्षेत्रीय लिम्फ नोड्स को प्रभावित किया है; या ट्यूमर कोलन की दीवार की किसी भी गहराई तक फैल गया है और 5 या अधिक क्षेत्रीय लिम्फ नोड्स को प्रभावित किया है।
चरण IIIC: ट्यूमर ने कोलन की दीवार को पूरी तरह से भेद दिया है, पास के अंगों में फैल गया हो सकता है, और 5 या अधिक क्षेत्रीय लिम्फ नोड्स को प्रभावित किया है।

चरण IV:
कोलन कैंसर शरीर के अन्य भागों जैसे यकृत, फेफड़े, अंडाशय या दूर के लिम्फ नोड्स में मेटास्टेसाइज होकर फैल गया है।
चरण IVA: कैंसर यकृत या फेफड़े जैसे एक दूर के अंग में या दूर के लिम्फ नोड्स के एक समूह में फैल गया है।
चरण IVB: कैंसर एक से अधिक दूर के अंगों में या दूर के लिम्फ नोड्स के एक से अधिक क्षेत्रों में फैल गया है।
चरण IVC: कैंसर पेरिटोनियम (पेट की परत) में फैल गया है और दूर के अंगों या लिम्फ नोड्स में भी फैल सकता है।