Dans le traitement de FIV, la qualité de l'embryon est l'un des facteurs les plus critiques influençant les chances de grossesse. Des ovocytes de haute qualité constituent la base du développement embryonnaire, et même un seul ovocyte de bonne qualité peut suffire pour une grossesse.

Les principaux facteurs affectant la qualité des ovocytes comprennent :
* L'âge de la femme
* La consommation de tabac
* Le niveau de FSH
* La dose d'hormones utilisées pour la stimulation ovarienne
* La réalisation opportune et appropriée de la procédure de ponction ovocytaire
* Les troubles génétiques

D'autres facteurs importants ayant un impact direct sur la qualité de l'embryon sont : la sélection de spermatozoïdes de qualité, les techniques avancées de sélection des spermatozoïdes, l'expérience de l'embryologiste pendant le processus de fécondation (ICSI), la technologie de laboratoire et l'utilisation de technologies de pointe.

Les embryons sont généralement évalués sur la base de critères morphologiques tels que le nombre de cellules, leur forme et l'égalité de leur taille. Pour augmenter le taux de réussite du traitement de FIV, un transfert d'embryon au 5ème jour (blastocyste) est généralement préféré. La raison en est que les blastocystes ayant atteint le 5ème jour ont statistiquement une meilleure chance d'implantation dans l'utérus par rapport aux embryons du 3ème jour.

Les systèmes de surveillance continue des embryons comme l'Embryoscope et les méthodes d'analyse génétique telles que le NGS (Séquençage de Nouvelle Génération) sont des techniques modernes qui aident à la sélection d'embryons de haute qualité et à l'augmentation des taux de réussite.

Bien que le risque d'anomalies génétiques soit faible chez les embryons ayant une bonne morphologie, il n'est pas totalement absent. Par conséquent, pour les couples confrontés à des échecs d'implantation récurrents malgré le transfert d'embryons de bonne qualité, l'analyse génétique de l'embryon (PGT-A/NGS) avant le transfert devrait être considérée comme une méthode pour améliorer le succès.

De plus, la santé de l'utérus et des trompes de Fallope est cruciale pour le succès du traitement. L'ablation laparoscopique des trompes de Fallope obstruées ou affectées par une hydrosalpinx (accumulation de liquide), ou la section de leur connexion à l'utérus, peut augmenter les chances de grossesse. L'élimination des adhérences, fibromes ou polypes détectés lors d'une hystéroscopie avant le transfert d'embryon aura un effet positif sur les résultats du traitement. De même, l'élimination hystéroscopique des polypes intra-utérins qui deviennent proéminents pendant la stimulation ovarienne augmente également les taux de grossesse.