L'étiologie précise de l'endométriose reste inconnue. La théorie la plus largement acceptée, connue sous le nom de menstruation rétrograde, postule que pendant le flux menstruel, le tissu endométrial s'écoule à rebours à travers les trompes de Fallope et s'implante dans les cavités pelvienne et abdominale, où il continue de se développer. Il est également émis l'hypothèse qu'une réponse immunitaire altérée pourrait contribuer à la persistance et à la prolifération de ces implants endométriaux ectopiques.