Omphalozele ist eine angeborene Anomalie, deren genaue Ursache nicht vollständig geklärt ist. Es wurden jedoch einige Faktoren identifiziert, die das Risiko einer Omphalozele erhöhen können:

* Genetische Prädispositionen
* Mütterlicher Alkohol- oder übermäßiger Nikotinkonsum während der Schwangerschaft (das Risiko kann im Vergleich zu Nichtkonsumentinnen höher sein)
* Bestimmte Medikamente, die während der Schwangerschaft eingenommen werden
* Verschiedene Umweltfaktoren