Omfalosel, doğuştan gelen bir anomalidir ve kesin nedeni tam olarak anlaşılamamıştır. Ancak omfalosel riskini artırabilecek bazı faktörler tanımlanmıştır:

* Genetik yatkınlıklar
* Hamilelik sırasında alkol veya aşırı sigara tüketimi (bu maddeleri kullanmayanlara kıyasla risk daha yüksek olabilir)
* Gebelik döneminde kullanılan bazı ilaçlar
* Çeşitli çevresel etkenler