Die Diagnose einer Epididymitis wird typischerweise durch eine körperliche Untersuchung gestellt. Eine digitale rektale Untersuchung kann durchgeführt werden, um eine Prostatavergrößerung oder -empfindlichkeit zu beurteilen. Bei urethralem Ausfluss kann eine Probe zur Laboranalyse entnommen werden, um sexuell übertragbare Infektionen wie Gonorrhoe und Chlamydien auszuschließen. Urin- und Blutproben werden auf Anomalien untersucht. Ein Farbdoppler-Ultraschall kann verwendet werden, um die Blutversorgung der Hoden zu beurteilen, was bei der Bestätigung der Diagnose einer Epididymitis hilft, indem Abweichungen vom normalen Blutfluss identifiziert werden.