Диагноз эпидидимита обычно устанавливается на основе физического осмотра. Может быть проведено пальцевое ректальное исследование для оценки увеличения или болезненности предстательной железы. При наличии уретральных выделений может быть взят образец для лабораторного анализа с целью скрининга на инфекции, передающиеся половым путем, такие как гонорея и хламидиоз. Образцы мочи и крови анализируются на предмет любых аномалий. Цветное допплеровское ультразвуковое исследование может быть использовано для оценки кровотока к яичкам, что помогает подтвердить диагноз эпидидимита путем выявления любых отклонений от нормального кровотока.