Kısırlık değerlendirmesi sırasında kapsamlı bir sistemik muayene esastır. Hastanın genel fiziksel görünümü bile altta yatan durumlar hakkında önemli ipuçları sağlayabilir. Örneğin, saç çizgisinin gerilememesi, tipik erkek ön saç çizgisi girintilerinin olmaması veya seyrek ya da hiç yüz kılı olmaması hormonal nedenlere işaret edebilir.

Bu başlangıç bulgularına ek olarak, muayene şunları da dikkatlice değerlendirmelidir:
* Jinekomasti (meme büyümesi) varlığı.
* Göğüs, koltuk altı, genital bölge ve bacaklar dahil olmak üzere vücut kıllarının gelişimi ve dağılımı.
* Penis ve testislerin morfolojisi (şekli).
* Testislerin skrotum içinde olup olmadığı.
* Varikosel varlığı.
* Vaz deferens (sperm kanalları) varlığı veya yokluğu.
* Obezitenin varlığı, doğurganlık üzerindeki potansiyel etkisi göz önüne alındığında.