बांझपन मूल्यांकन के दौरान एक व्यापक प्रणालीगत जांच आवश्यक है। यहां तक कि रोगी की सामान्य शारीरिक उपस्थिति भी अंतर्निहित स्थितियों के बारे में महत्वपूर्ण सुराग प्रदान कर सकती है। उदाहरण के लिए, बालों की घटती हुई रेखा का अभाव, विशिष्ट पुरुष फ्रंटल हेयरलाइन इंडेंटेशन की कमी, या चेहरे के बालों का कम या बिल्कुल न होना हार्मोनल कारणों का संकेत दे सकता है।

इन प्रारंभिक निष्कर्षों के अतिरिक्त, जांच में निम्नलिखित का भी गहनता से आकलन किया जाना चाहिए:
* गाइनेकोमास्टिया (स्तनों का बढ़ना) की उपस्थिति।
* शरीर के बालों का विकास और वितरण, जिसमें छाती, बगल, जननांग और पैर शामिल हैं।
* शिश्न और अंडकोष की आकृति विज्ञान (मॉर्फोलॉजी)।
* अंडकोष का अंडकोश के भीतर होना।
* वैरिकोसील की उपस्थिति।
* शुक्रवाहिनी (स्पर्म डक्ट्स) की उपस्थिति या अनुपस्थिति।
* मोटापे की उपस्थिति, क्योंकि इसका प्रजनन क्षमता पर संभावित प्रभाव पड़ सकता है।