Kronik orta kulak iltihabı tedavisinde konservatif yöntemlerin (ilaç tedavisi) yetersiz kaldığı durumlarda cerrahi müdahale önerilmektedir. Cerrahi tedavi, hastalığın yaygınlığına ve tipine göre farklılık gösterir.

Basit vakalarda, özellikle kulak zarında delik bulunan ve ek patoloji içermeyen hastalarda kulak zarı onarımı (Timpanoplasti) yapılır. Bu ameliyatlar genellikle kulak mikroskopu altında, çoğunlukla kulak arkasından veya kulak kepçesinin üst ön kısmından yapılan küçük bir kesi ile gerçekleştirilir.

Hastalığın daha ilerlediği ve orta kulak kemik yapılarını etkilediği durumlarda, cerrahi tedavi bu bölgeleri de kapsayacak şekilde genişletilir.

Kolesteatom, kronik orta kulak iltihabının özel ve ciddi bir formudur ve tedavisi aciliyet arz eder. Kolesteatom, orta kulakta anormal olarak büyüyen ve çevresindeki dokulara zarar veren bir cilt birikintisi olarak tanımlanır. Büyüdükçe yüz felcinden beyin apselerine kadar uzanan ciddi komplikasyonlara yol açabilir. Bu nedenle, kolesteatom tanısı konulan vakalarda, hastalığın ilerlemesini durdurmak ve potansiyel komplikasyonları önlemek amacıyla hastalıklı dokuların cerrahi olarak çıkarılması ve sonrasında rehabilitasyon süreci vakit kaybetmeden başlatılmalıdır.