पुरानी मध्य कान के संक्रमण के उपचार में, जब रूढ़िवादी तरीके (दवा उपचार) अपर्याप्त होते हैं, तो सर्जिकल हस्तक्षेप की सिफारिश की जाती है। सर्जिकल उपचार रोग की सीमा और प्रकार के अनुसार भिन्न होता है।

सरल मामलों में, विशेष रूप से उन रोगियों में जिनके कान के परदे में छेद है और कोई अतिरिक्त पैथोलॉजी नहीं है, कान के परदे की मरम्मत (टिम्पेनोप्लास्टी) की जाती है। ये ऑपरेशन आमतौर पर कान माइक्रोस्कोप के तहत किए जाते हैं, आमतौर पर कान के पीछे या कान के ऊपरी सामने वाले हिस्से से एक छोटे चीरे के माध्यम से।

उन मामलों में जहां रोग बढ़ गया है और मध्य कान की हड्डी की संरचनाओं को प्रभावित करता है, सर्जिकल उपचार इन क्षेत्रों को भी कवर करने के लिए बढ़ाया जाता है।

कोलेस्टेटोमा पुरानी मध्य कान के संक्रमण का एक विशेष और गंभीर रूप है, जिसके लिए तत्काल उपचार की आवश्यकता होती है। कोलेस्टेटोमा को मध्य कान में असामान्य रूप से बढ़ने वाले त्वचा के जमाव के रूप में परिभाषित किया जाता है जो आसपास के ऊतकों को नुकसान पहुंचाता है। जैसे-जैसे यह बढ़ता है, यह चेहरे के पक्षाघात से लेकर मस्तिष्क के फोड़ों तक गंभीर जटिलताओं का कारण बन सकता है। इसलिए, कोलेस्टेटोमा के निदान वाले मामलों में, रोग की प्रगति को रोकने और संभावित जटिलताओं को रोकने के लिए, रोगग्रस्त ऊतकों को सर्जिकल रूप से हटाना और उसके बाद पुनर्वास प्रक्रिया बिना किसी देरी के शुरू की जानी चाहिए।