Omfalosel onarımına yönelik cerrahi yaklaşım, defektin büyüklüğüne göre farklılık gösterir.
Minör omfalosel vakalarında, doğumdan kısa bir süre sonra karın duvarı dışındaki kesede bulunan organlar karın boşluğuna dikkatlice yerleştirilir ve defekt cerrahi olarak kapatılır.
Majör omfalosel durumlarında ise tedavi genellikle aşamalı onarım veya greft yama kullanımı gerektirebilir. Özellikle karaciğer ve diğer iç organları içeren büyük omfalosellerde, dışarıdaki organların tek seferde karın boşluğuna yerleştirilmesi mümkün olmayabilir. Bu durum, bebeğin karın boşluğunun yetersiz hacmi veya solunum fonksiyonlarıyla ilgili potansiyel sorunlar nedeniyle ortaya çıkabilir. Bu tür vakalarda, cerrahi onarım zaman içinde kademeli olarak gerçekleştirilir.