Для лечения энтеробиоза (инфекций острицами) доступны как безрецептурные, так и рецептурные антигельминтные препараты. Лечение обычно включает две дозы, вводимые с интервалом в две недели. Чтобы предотвратить повторное заражение и распространение, в большинстве случаев рекомендуется, чтобы члены семьи и опекуны проходили лечение одновременно с инфицированным человеком. Строгое соблюдение гигиены крайне важно на протяжении всего периода лечения и до завершения всех доз.

Протозойные кишечные инфекции, однако, не всегда требуют лечения. Легкие инфекции у здоровых людей часто проходят самостоятельно в течение нескольких недель. Тем не менее, тяжелые или стойкие инфекции, а также инфекции у людей с ослабленной иммунной системой, как правило, требуют медикаментозного лечения. Врачи могут назначать различные противопаразитарные препараты в зависимости от конкретного типа паразита. В случае диареи также крайне важно обеспечить достаточное потребление жидкости для предотвращения осложнений.