Точная причина саркомы Юинга, как и большинства злокачественных опухолей, как правило, неизвестна. Однако существуют убедительные доказательства того, что развитие специфической ошибки или аномалии в генетических кодах (чаще всего хромосомной транслокации) может играть значительную роль в возникновении заболевания.