Для одноплодных беременностей зачатие с помощью ЭКО само по себе не увеличивает риск выкидыша; такие беременности отслеживаются аналогично естественно зачатым беременностям. Однако многоплодные беременности, которые чаще встречаются при ЭКО, несут повышенный риск выкидыша. Кроме того, бесплодные пары, независимо от способа зачатия, обычно имеют более высокую предрасположенность к генетическим аномалиям по сравнению с общей популяцией. Этот основной фактор означает, что беременности у таких пар (будь то естественным путем или с помощью ЭКО) могут столкнуться с относительно более высоким риском генетических проблем и, как следствие, выкидыша.