Pour les grossesses uniques, la conception par FIV n'augmente pas intrinsèquement le risque de fausse couche ; ces grossesses sont suivies de manière similaire aux grossesses conçues naturellement. Cependant, les grossesses multiples, plus fréquentes avec la FIV, comportent un risque accru de fausse couche. De plus, les couples infertiles, quelle que soit la méthode de conception, présentent généralement une prédisposition plus élevée aux anomalies génétiques par rapport à la population générale. Ce facteur sous-jacent signifie que les grossesses chez ces couples (qu'elles soient obtenues naturellement ou par FIV) peuvent être confrontées à un risque relativement plus élevé de problèmes génétiques et, par conséquent, de fausse couche.