Рукавная гастрэктомия, как и другие бариатрические и метаболические хирургические процедуры, обычно противопоказана пациентам с серьезными неконтролируемыми медицинскими состояниями, такими как активное заболевание сердца, прогрессирующая легочная недостаточность или активное злокачественное новообразование. Кроме того, лица, не обладающие когнитивными способностями для полного понимания хирургического процесса, его рисков и обязательных послеоперационных диетических и жизненных изменений (будь то из-за врожденных состояний или приобретенных нарушений), не считаются подходящими кандидатами. В частности, для рукавной гастрэктомии пациентам с тяжелой предсуществующей гастроэзофагеальной рефлюксной болезнью (ГЭРБ) обычно не рекомендуется эта процедура.