Como as doenças autoimunes abrangem um amplo espectro, seus sintomas podem variar significativamente dependendo do tipo. No entanto, alguns sintomas comuns podem ser observados em muitas condições autoimunes. Os sintomas mais comuns das doenças autoimunes incluem: dor e inchaço nas articulações, fadiga crônica, problemas de pele, dor abdominal, problemas digestivos, febre e gânglios linfáticos inchados.