Durante um procedimento de colposcopia, o instrumento do colposcópio não entra na vagina, portanto, geralmente não se sente dor ou desconforto intenso. No entanto, uma ligeira sensação de pressão pode ocorrer devido ao espéculo vaginal usado para visualizar claramente o colo do útero. Soluções especiais aplicadas para limpar o colo do útero para uma visualização mais clara podem causar uma breve sensação de picada ou queimação. Se áreas suspeitas forem detectadas durante a colposcopia e uma biópsia for necessária, a experiência sentida pode variar dependendo da área de onde a biópsia é retirada: As biópsias retiradas do colo do útero (região cervical) geralmente não são dolorosas, pois essa área não é rica em terminações nervosas; as pacientes podem sentir uma leve pressão ou uma sensação semelhante a cólicas menstruais. No entanto, as biópsias retiradas das partes inferiores da vagina ou da vulva podem ser mais sensíveis e causar dor. Em alguns casos, anestesia local pode ser administrada quando várias amostras precisam ser coletadas ou para aumentar o conforto da paciente.