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अल्सर का निदान करने का सबसे सटीक तरीका एंडोस्कोपी है। यह तकनीक घाव को सीधे देखने और आवश्यकतानुसार ऊतक के नमूने लेने की अनुमति देती है। कुछ मामलों में, पेट और ग्रहणी का बेरियम एक्स-रे एंडोस्कोपी के पूरक के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है। पेट के कैंसर में अल्सर के बढ़ने से रोकने के लिए एंडोस्कोपी द्वारा अल्सर का शीघ्र निदान महत्वपूर्ण है।