पेटेंट फोरामेन ओवाले (पीएफओ) का सटीक कारण अभी तक पूरी तरह से समझा नहीं गया है। भ्रूण काल के दौरान, हृदय के दाहिने और बाएं ऊपरी कक्षों (अलिंदों) के बीच फोरामेन ओवाले नामक एक फ्लैप जैसी संरचना होती है, जो सामान्यतः जन्म के बाद बचपन में स्वतः बंद हो जाती है। हालांकि, कुछ मामलों में, यह छेद अज्ञात कारणों से खुला रह सकता है।