क्रॉस-लिंकिंग को एक अत्यधिक विश्वसनीय तरीका माना जाता है जब विस्तृत रोगी मूल्यांकन से सही रोगी का चयन होता है, उच्च गुणवत्ता वाले उपकरण और समाधानों का उपयोग किया जाता है, और सख्त स्वच्छता प्रोटोकॉल का सावधानीपूर्वक पालन किया जाता है। फिर भी, किसी भी चिकित्सा प्रक्रिया की तरह, क्रॉस-लिंकिंग के भी संभावित दुष्प्रभाव और जटिलताएं होती हैं। यह अत्यंत महत्वपूर्ण है कि इन जोखिमों को प्रक्रिया से पहले रोगी और उनके रिश्तेदारों को पूरी तरह से समझाया जाए।