प्रसवपूर्व स्क्रीनिंग परीक्षण आमतौर पर मां और बच्चे दोनों के लिए सुरक्षित माने जाते हैं और इन्हें उन सभी गर्भवती व्यक्तियों के लिए किया जा सकता है जो इनका विकल्प चुनते हैं। हालांकि, इनवेसिव प्रसवपूर्व नैदानिक ​​प्रक्रियाएं, जिनमें एक सुई के साथ बाँझ गर्भाशय के आंतरिक वातावरण में प्रवेश करना शामिल है, गर्भपात का एक छोटा जोखिम उठाती हैं। एम्नियोसेंटेसिस और कोरियोनिक विलस सैंपलिंग (सीवीएस) के लिए, यह जोखिम लगभग 200 में 1 से 400 में 1 होता है। कॉर्ड रक्त नमूनाकरण (कॉर्डोसेंटेसिस) के लिए, जोखिम लगभग 100 में 2 होता है।