Os testes de rastreio pré-natal são geralmente considerados seguros tanto para a mãe quanto para o bebê e podem ser realizados em todas as gestantes que optem por eles. No entanto, os procedimentos diagnósticos pré-natais invasivos, que envolvem a entrada no ambiente intrauterino estéril com uma agulha, carregam um pequeno risco de aborto espontâneo. Para a amniocentese e a biópsia de vilosidades coriônicas (BVC), esse risco é de aproximadamente 1 em 200 a 1 em 400. Para a amostragem de sangue do cordão umbilical (cordocentese), o risco é de cerca de 2 em 100.