स्टेम सेल थेरेपी का उपयोग हड्डी रोग विज्ञान में कुछ जोड़ों की स्थितियों के इलाज के लिए किया जाता है। यह उन रोगियों के लिए एक विकल्प हो सकता है, विशेष रूप से कंधे, कूल्हे और घुटने जैसे जोड़ों में कार्टिलेज क्षति और संबंधित दर्द का अनुभव करने वाले, जिन्हें अभी तक सर्जिकल हस्तक्षेप की आवश्यकता नहीं है या जो सर्जरी नहीं कराना चाहते हैं। हालांकि, जोड़ों के कार्टिलेज के महत्वपूर्ण या लगभग कुल नुकसान के मामलों में, स्टेम सेल थेरेपी आमतौर पर एक उपयुक्त उपचार विकल्प नहीं है।