Le diagnostic de la dysenterie implique une évaluation complète. Cela inclut généralement l'évaluation des symptômes présentés par le patient, en particulier la diarrhée, et les résultats d'un examen physique. Pour un diagnostic définitif et l'identification de l'agent causal, les investigations de laboratoire sont cruciales. Celles-ci comprennent souvent l'examen microscopique des échantillons de selles, la coproculture et des tests moléculaires tels que l'ELISA ou la PCR.