O diagnóstico da disenteria envolve uma avaliação abrangente. Isso geralmente inclui a avaliação dos sintomas apresentados pelo paciente, particularmente diarreia, e os achados de um exame físico. Para um diagnóstico definitivo e a identificação do agente causador, as investigações laboratoriais são cruciais. Estas frequentemente incluem exame microscópico de amostras de fezes, cultura de fezes e testes moleculares como ELISA ou PCR.