Kolonoskop, ucunda entegre bir kamera ve ışık kaynağı barındıran esnek bir tüp formundadır. Cihaz, kalın bağırsağın detaylı görüntülenmesini kolaylaştırmak amacıyla hava insüflasyon mekanizmasına ve gerekli durumlarda polip gibi yapıların çıkarılmasına olanak tanıyan bir çalışma kanalına sahiptir. Kolonoskopun bu esnek kısmı, genellikle yaklaşık 60 cm uzunluğunda ve 1 cm çapındadır.