Gebelik döneminde alerji aşı tedavisine genellikle başlanmaz. Ancak, alerji aşı tedavisine gebelik öncesinde başlanmış ve tedavi sırasında gebelik oluşmuşsa, hasta ile detaylı bir görüşme yapılır. Bu görüşmede, tedavinin devam etmesinin veya sonlandırılmasının potansiyel riskleri ve faydaları değerlendirilerek kişiselleştirilmiş bir kar-zarar analizi yapılır. Bu analizin sonucuna göre, tedaviye devam etme veya ara verme kararı hasta ile birlikte verilir.