Bir doktor penis kanserinden şüphelenirse, kesin tanı için biyopsi önerecektir. Biyopsi, penis veya lenf düğümlerinden küçük bir doku örneği alınarak laboratuvarda detaylı incelenmesini içerir. Bu işlem, kanser hücrelerinin varlığını ve tipini doğrulamak amacıyla yapılır. Genel olarak üç ana biyopsi türü mevcuttur: İnsizyonel biyopsi: Bu yöntemde, anormal görünen dokunun sadece bir kısmı cerrahi olarak çıkarılır. Genellikle büyük lezyonlar, yaralar, ülserasyonlar veya dokunun derinliklerine yayıldığı düşünülen lezyonlar için uygulanır.