Ebola virüsü, soğuk algınlığı, grip veya kızamık gibi havayoluyla kolayca yayılan yaygın hastalıkların aksine, öncelikle doğrudan temas yoluyla bulaşır. Hastalık belirtileri ortaya çıkmadan önce virüsün yayılması söz konusu değildir.

İnsanlar arasında Ebola virüsü, yalnızca enfekte bir kişinin idrar, tükürük, ter, dışkı, kusmuk, anne sütü ve meni gibi vücut sıvılarıyla doğrudan temas edildiğinde bulaşır. Virüs, ciltteki çatlaklardan veya gözler, burun ve ağız gibi mukoza zarlarından vücuda girebilir.

Dolaylı bulaşma, virüsle enfekte olmuş bir kişinin vücut sıvılarıyla kirlenmiş yüzeyler veya nesnelerle temas yoluyla da gerçekleşebilir. Bunlara örnek olarak şunlar verilebilir:
* Yatak örtüleri
* Kıyafetler
* Bandajlar, yara bantları
* İğneler ve şırıngalar
* Tıbbi ekipman
* Havlular

Virüs, insanlara başlangıçta enfekte vahşi hayvanlardan (özellikle yarasalar, primatlar ve orman antilopları) avcılık veya kesim sırasında kanları veya diğer vücut sıvılarıyla doğrudan temas yoluyla geçebilir.