Во время процедуры ЭМГ к телу прикладываются безвредные электрические стимулы низкой частоты. Эти стимулы, как правило, не вызывают боли. Уровень дискомфорта, вызванного одноразовыми стерильными игольчатыми электродами, вводимыми в мышцы, также обычно очень незначителен. Редко в местах введения иглы могут возникать небольшие подкожные кровотечения или легкие синяки.