Золотым стандартом диагностики ахалазии является манометрия пищевода. Это исследование выявляет высокое давление нижнего пищеводного сфинктера (НПС) и недостаточное расслабление при глотании. В диагностическом процессе также используются дополнительные методы, такие как эзофагография (рентген пищевода с барием) и эндоскопия. Эзофагография обычно показывает расширение верхней части пищевода и характерное сужение в дистальном отделе в виде "птичьего клюва". Эндоскопическое исследование выявляет значительное сопротивление в области нижнего пищеводного сфинктера; пищевод дистально выглядит суженным, и иногда могут наблюдаться вторичные изменения, вызванные хроническим застоем, например, грибковый эзофагит.