МРТ не проводится пациентам, которые отказываются проходить обследование из-за сильной клаустрофобии. Для пациентов с почечной недостаточностью, у которых уровень мочевины и креатинина в крови превышает определенный порог, перед процедурой обязательна предварительная оценка врачом. Общие правила безопасности МРТ также применимы к процедурам кардиологической МРТ. Сканирование не рекомендуется, если у пациента в теле есть металлическая протез, кардиостимулятор или любой электронный имплант, несовместимый с МРТ. Если присутствуют кардиостимуляторы или металлические клапаны, они должны быть совместимы с МРТ. Перед процедурой необходимо обязательно спросить пациента, есть ли у него в теле металлический протез, кардиостимулятор, металлический клапан или любой другой металлический имплант; все металлические предметы, такие как пирсинг, должны быть удалены.