Os principais métodos cirúrgicos utilizados no tratamento da paralisia diafragmática são a plicação e as cirurgias de marca-passo diafragmático, que apoiam a função mecânica do diafragma. As complicações mais comuns após a cirurgia de plicação incluem a reelevação do diafragma, sua disfunção mecânica e a recorrência da falta de ar. Além disso, outras complicações como sangramentos devido à cirurgia ou ruptura do diafragma podem ocorrer. Entre as complicações que podem ser observadas após a cirurgia de marca-passo diafragmático, encontra-se o deslocamento da ponta do eletrodo colocado no diafragma ou sua incapacidade de transmitir sinais suficientes, resultando em falta de ar. Uma vez que o diafragma é um órgão mecânico, problemas que surgem após estas cirurgias devido a mudanças de pressão e à técnica cirúrgica utilizada podem recorrer.