Los principales métodos quirúrgicos utilizados en el tratamiento de la parálisis diafragmática son la plicación y las cirugías de marcapasos diafragmático, que apoyan la función mecánica del diafragma. Las complicaciones más comunes después de la cirugía de plicación incluyen la reelevación del diafragma, su disfunción mecánica y la recurrencia de la dificultad para respirar. Además, pueden presentarse otras complicaciones como hemorragias relacionadas con la cirugía o desgarro del diafragma. Entre las complicaciones que pueden observarse después de la cirugía de marcapasos diafragmático se encuentra el desplazamiento de la punta del electrodo colocado en el diafragma o su incapacidad para transmitir señales suficientes, lo que lleva a dificultad para respirar. Dado que el diafragma es un órgano mecánico, los problemas que surgen después de estas cirugías debido a los cambios de presión y la técnica quirúrgica utilizada pueden reaparecer.