A sialendoscopia tipicamente apresenta uma incidência notavelmente menor de complicações quando comparada com os procedimentos de cirurgia aberta tradicionais. Embora essas ocorrências sejam raras, as complicações potenciais podem incluir:
* Dor
* Inchaço
* Trauma ductal
* Fístula salivar
* Recorrência da condição
* Parestesia lingual