La sialendoscopia presenta típicamente una incidencia de complicaciones notablemente menor en comparación con los procedimientos quirúrgicos abiertos tradicionales. Si bien estas ocurrencias son raras, las complicaciones potenciales pueden incluir:
* Dolor
* Hinchazón
* Trauma ductal
* Fístula salival
* Recurrencia de la condición
* Parestesia lingual