O sucesso do tratamento da espinha bífida está diretamente relacionado com a gravidade da condição e o grau de afetação dos nervos. Em casos onde os nervos estão danificados ao ponto de perder completamente a sua função, geralmente não é possível reverter este dano. Nestas situações, o objetivo principal do tratamento é preservar as funções existentes ao mais alto nível possível e prevenir potenciais complicações. Após a intervenção cirúrgica que encerra o sistema nervoso para protegê-lo de infeções, são implementados tratamentos de suporte adaptados às necessidades específicas do paciente. Estes tratamentos incluem fisioterapia para a fraqueza muscular, tratamentos ortopédicos corretivos para problemas ortopédicos, e terapias destinadas a melhorar o controlo da bexiga e do intestino. Embora algumas questões possam não ser aparentes no período inicial, podem surgir como problemas secundários ao longo do tempo. Exemplos incluem a síndrome da medula ancorada (tethered cord syndrome), escoliose ou cifose que podem desenvolver-se durante o crescimento, e deformidades nos pés. Tratamentos e intervenções adicionais podem ser necessários para a gestão destas condições secundárias.